El proyecto establece como área de salvaguarda ambiental el cauce principal del Río Pacuare y todos sus afluentes desde su nacimiento en la cuenca alta hasta la localización 10°07'08.0"N 83°28'18.0"W (en grados sexagesimales) equivalente a Este (E): 557 899.91 m; Norte (N): 1 118 939.81 m (en proyección cartográfica CR-SIRGAS) en Indiana Dos, Siquirres, y prohíbe el desarrollo de proyectos hidroeléctricos a lo largo del área de salvaguarda, con la finalidad de que el cauce se mantenga libre de barreras físicas permitiendo el equilibrio ambiental del mismo.